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산업통상자원부

면역항암제 치료반응 유전체-임상정보 통합 DB기반 사업화 모델 개발

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작성자관리자 작성일 19-04-19 15:56

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성과명 면역항암제 치료반응 유전체-임상정보 통합 DB기반 사업화 모델 개발 조회 131회
사업명 포스트게놈 다부처 유전체사업 지원기관 산업통상자원부
연구자명 최정균 연구기관 KAIST
등록일 2018-07-03 발간일 2018-08-28

 논문제목 :immune signatures correlate with l1 retrotransposition in gastrointestinal cancers


◆ 저널명 Genome Research


◆ Abstract

긴 interspersed nuclear element-1 (LINE-1 또는 L1) retrotransposons은 일반적으로 체세포 조직에서 DNA 메틸화와 항 바이러스 방어때문에 억제된다. 그러나, L1s를 억제하는 메커니즘은 암에서 방해되어 L1이 삽입 돌연변이 원으로 작용하여 게놈 재배열 및 불안정성을 유발할 수있다. 반면에 체세포의 L1 삽입의 빈도는 개별 종양마다 큰 차이가 있지만, 기초적인 유전적, 세포적, 환경적 요인에 대해서는 많은 것을 알아야 한다. 여기에서는 암 전체 게놈 및 일치하는 RNA 시퀀싱 프로파일의 통합 분석을 통해 위, 대장 및 식도 종양에서 L1 활동의 여러 상관 관계를 보고한다. 종양의 분화도 및 환자 연령과 같은 종양 진행의 임상 지표는 긍정적인 연관성을 보였다. 잠재적인 L1 발현 억제인자, TP53은 빈번한 L1 삽입으로 종양에서 돌연변이를 일으켰다. 우리는 체세포의 L1 삽입이 mRNA splicing과 expression에 미치는 영향을 특징짓고, 복강전성 암에서 유전자 교란 위험이 증가한다는 것을 증명했다. 특히 L1 억제인자인 MOV10 엑손의 암 특이적 L1 삽입은 L1 삽입 부하가 높은 종양에서 말도 안 되는 중성화로 인해 exon 건너뛰기를 유발하고 영향을 받는 알레르기의 발현 감소를 유발한다는 것을 알아냈다. 요한 것은, 예를 들어, 엡스타인-바르 바이러스 감염이나 마이크로위성 불안정 등과 관련된 종양들은 APOBEC3s와 SAMHD1과 같은 L1 억제기의 높은 발현 수준을 가진 게놈에 L1 삽입물 수가 적은 경향이 있었다. 우리의 결과는 암 면역이 위암에서 L1의 역전을 억제함으로써 게놈 안정성에 기여할 수 있다는 것을 보여준다.

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