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전사체 기반의 전장 유전체 연관 분석을 통한 대립성 밤나무 선발 기술 개발

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작성자관리자 작성일 20-06-25 16:13

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성과명 전사체 기반의 전장 유전체 연관 분석을 통한 대립성 밤나무 선발 기술 개발 조회 114회
사업명 산림자원유전체해독사업 지원기관 산림청
연구자명 박응준 연구기관 국립산림과학원
등록일 2019-08-28 발간일 2019-09-11

◆ 논문제목 : Identification of transcriptome-wide, nut weight-associated SNPs in Castanea crenata.


◆ 저널명 : Scientific Reports


◆ 내용 

- 전사체 기반의 전장 유전체 연관 분석(Transcriptome-based Genome-Wide Association Study)을 통해 대립성 밤나무(Castanea crenata)를 선발할 수 있는 21개의 SNPs를 선발하였으며, 다양한 알고리즘을 이용한 기계학습을 통해 구축된 밤의 입중(nut weight) 예측 모델은 다른 검증 집단에서도 정확도가 68% 이상 되는 것을 확인함.


- 비타민과 영양분이 풍부한 밤은 아시아를 포함한 세계 각국에서 중요한 식량 작물로 이용되고 있다. 전 세계 밤 생산의 89.6%를 아시아에서 생산하고 있으며, 한국은 중국 다음으로 밤을 제일 많이 생산하는 세계 제2위의 밤 생산국이다.  


- 우리나라 밤 품종은 대부분 교배를 통한 선발을 통해 개발됐으나, 장기간의 육종 기간(10년 이상)이 소요됨에 따라 다양한 수요자들의 요구에 부응하기에는 역부족이었다.


- 본 연구에서는 임목에서도 디지털 육종방식이 적용·개발될 수 있다는 가능성을 국내 최초로 제시하였으며, 특히 세대 진전에 장기간이 소요되는 임목의 육종 패러다임 전환에 중요한 역할을 할 것으로 보인다. 


- 현재 식물육종은 과거 아날로그식 관행육종에서 유전체 등 빅데이터 기반의 디지털육종으로 패러다임이 변화하고 있으며, 품종화되지 않은 재래종에 산재해 있는 유용 유전자를 최적화된 형태로 조립하는 방식으로 변화할 것으로 예상된다. 


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