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40대 전후 발생하는 조기발병위암 원인 정밀 규명

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작성자관리자 작성일 20-06-25 16:46

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성과명 40대 전후 발생하는 조기발병위암 원인 정밀 규명 조회 168회
사업명 40대 전후 발생하는 조기발병위암 원인 정밀 규명 지원기관 과학기술정보통신부
연구자명 이상원 연구기관 고려대학교
등록일 2019-01-14 발간일 2019-01-14

◆ 논문제목 : Proteogenomic Characterization of Human EarlyOnset Gastric Cancer


◆ 저널명 : Cancer Cell


◆ 내용 


-  ‘비연속적 시료 분획 및 통합’기술을 온라인 이차원 액체크로마토그래피 장치에 도입한 세계 최초의 기술 개발.


- 일반적인 역상-역상 이차원 크로마토그래피 방법과 비교하여 분리직교성을 크게 향상시켰으며, 시료의 복잡성을 낮추고 분획 시료의 균일성을 높이는 비연속적 시료 분획 및 통합과정을 자동화하여, 분획 재현성 향상과 시료의 손실을 최소화 함. 이를 통해 극미량의 시료로부터 고효율, 고감도의 LC-MS/MS 분석이 가능하도록 하여, 췌장암 조직에 대한 심도있는 글로벌 단백체 및 인산화 단백체 정량 프로파일링을 가능하게 하였음


- 분석분야 최고 저널 중 하나인 ‘Analytical Chemistry’(IF 6.350) 에 논문 게재(Anal. Chem. 2016, 88, 11734-11741 ) 및 국내 액체크로마토그래피기술 중 최초로 5극 특허(한국, 중국, 일본, 미국, EU)를 출원함.



- 본 사업의 목표는 췌장암에 대한 유전단백체 통합분석을 통해 췌장암 치료불응성 예측기술의 기반인 유전단백체 다중마커를 발굴하고, 그 유효성에 대한 분자기전을 규명하고자 함이며 또한 발굴된 유전단백체 다중마커에 의한 신의료기술 수립을 위한 검증연구를 수행하는 것이다. 이러한 목표를 달성하기 위해 가장 핵심이 되는 요소는 췌장암 조직에 대한 광범위하고, 심도 있는 단백체 정량 프로파일링을 수행하는 것이다.


- 글로벌 프로파일링은 동정된 단백체의 정량 정보를 제공하며 이 정보는 mRNA발현 데이터에 의한 copy number variants 정보와 연계하여 암질환 특이적 발현 단백질의 대량 동정을 가능하게 하므로 유전체 분석 coverage를 효과적으로 보완하는 광범위한 글로벌 단백체 프로파일링 기술이 요구된다. 특히 종양 특이적 네트워크에서 특정 pathway의 activity에 가중치를 부여할 수 있는 인산화 단백질에 대한 고감도의 광범위한 프로파일링 기술이 필수적이다. 이를 위해서는 단백체 시료의 복잡성 문제를 해결함과 동시에 단백체 정보의 손실을 최소화할 수 있는 기술을 필요로 한다.


- 본 기술은 ‘비연속적 시료 분획 및 통합’ 기술을 적용하여 일차원 분리를 통해 시료의 복잡성을 크게 감소시킬 뿐 아니라 얻어진 분획시료의 복잡성이 서로 균등하도록 하였으며, 이를 통해 이차원 분리 과정에서의 분리공간과 분리봉우리량을 극대화할 수 있다. 동시에 이러한 모든 과정이 온라인으로 연결되어 있기 때문에 분석 과정에서 시료의 손실과 이로 인한 단백체 정보의 손실을 최소화할 수 있다. 본 기술은 이러한 장점들을 동시에 가지고 있는 세계 유일의 기술이며, 따라서 앞서 언급한 본 과제의 핵심 요구사항들을 만족시킬 수 있는 유일한 기술이다. 


- 또한 본 기술은 시료 주입 이후에 연구자의 개입이 불필요하며, 휴지시간이 없이 계속해서 데이터를 얻을 수 있다는 점에서 많은 수의 시료 분석이 요구되는 본 과제에서 분석의 효율을 극대화할 수 있는 핵심 기술이다.


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