계통전사체 분석 파이프라인 구축과 검증 > 주요연구성과

본문 바로가기
사이트 내 전체검색

해양수산부

계통전사체 분석 파이프라인 구축과 검증

페이지 정보

작성자관리자 작성일 21-02-08 17:41

본문

성과명 계통전사체 분석 파이프라인 구축과 검증 조회 293회
사업명 포스트게놈 다부처 유전체사업 지원기관 해양수산부
연구자명 박춘구 연구기관 전남대학교
등록일 2020-07-13 발간일 2020-07-13

◆ 논문제목 : Is Phylotranscriptomics as Reliable as Phylogenomics?


◆ 저널명 : Mololecular Biology and Evolution


◆ 내용


- 차세대 염기서열 분석 방법(NGS)의 발달과 함께 최신 분자 진화학 연구가 진행되고 있으나, 계통분석을 위한 유전체 정보 확보에는 많은 비용과 시간을 필요로 함.


- mRNA 정보만을 이용하는 계통 전사체학 분류 방법론이 개발되었으나, 유전체에 비해 부분적이며, 환경 및 조직 특이적인 발현에 따른 편차가 있기 때문에 분류 방법의 정확성 검증에 어려움이 있음.


- 포유류와 식물의 유전체, 전사체 정보를 각각 활용하여 작성한 계통 유전체 분류도와 계통 전사체 분류도를 비교하고, 각각 다른 총 10가지의 조직에서 확보한 전사체 정보를 사용하여 작성한 계통 전사체 분류도를 비교함으로서 orthologs 유전자의 추론 방법에 따라 계통 전사체 분류 방법의 정확도가 달라질 수 있으나, 전사체를 확보하기 위한 조직이나 분류군에 따라 영향을 받지 않는다는 사실을 확인하였음.


- 본 연구에서 개발한 새로운 계통 전사체 분석 방법은 이러한 비용을 절감하고, 높은 정확도와 많은 데이터를 활용한 계통 분류 방법을 사용할 수 있다는 점이 있으며, 이를 활용하여 미개척 분류군에 대한 전사체 연구나, 기존에 누적되어 연구된 유전체, 전사체 정보를 활용한 계통 분류 연구가 가능함.


752ff54c1dfd1012a4eeb9b82f34da64_1612773659_6522.PNG
 

첨부파일


Copyright © kpgp.or.kr All rights reserved. Login

포스트게놈 다부처 유전체사업 총괄지원단 [07027] 서울특별시 동작구 사당로 46 숭실대학교 창의관 101호
KPGP, 101 Chang Eui Gwan, Soongsil University, Sadang-Ro 46, Dongjak-Gu, Seoul 06978, Korea
TEL : +82-2-826-8830~1 / FAX : +82-2-826-8832